El Comején volador reina (Queen Shearwig en inglés) es el quinto jefe de Hey! Pikmin. Ella es la reina de los comejenes voladores y se parece mucho a ellos, solo que es más grande, es de color rosa, y su pico parece un taladro. Tiene un ejército de comejenes voladores al igual que el Abejardo jefe tiene un ejercito de Abejardos soldado en Pikmin 3.
Durante la batalla iremos bajando un abismo mientras nos sujetan los Pikmin alados.
Ella manda a su ejército de Comejenes a que te ataquen; lo pueden hacer de diferentes maneras. También baja ella a atacarte con su pico como si de un taladro se tratase.
Para derrotarla hay que eliminar primero a los Comejenes voladores con los Pikmin alados, y luego concentrarse en atacar a la reina mientras no la protegen.